新冠疫情: 新冠病毒是怎麼產生的?美研究醬說

2020-02-20 | 來源: 新京報 | 轉到微信 | 有0人參與評論 | 字體: 放大縮小 | 收藏 | 打印

　　▲圖片來源：新京報網

　　文 | 鄭偉彬

　　2月18日，美國哥倫比亞大學和哈佛大學研究團隊在預印本平台bioRxiv上發表論文《Recombination and convergent evolution led to the emergence of 2019 Wuhan coronavirus》。

　　該論文指出，通過對病毒基因的研究發現，2019年的新冠病毒最早可能在2009年就通過重組，獲得了SARS的遺傳特征，並在此後通過融合進化成今日的新冠病毒。

　　新冠病毒是一種此前未被發現的新型RNA冠狀病毒。它在核苷酸水平上與SARS病毒具有80%的相似性。

　　SARS病毒和新冠病毒均屬於目前知道的可以感染人類的Sarbecovirus亞屬β冠狀病毒。該屬的其他病毒經常在蝙蝠中出現。

　　由於病毒種群在新宿主中的能力可以通過快速突變率和重組等因素來解釋。一般來說，這些因素導致了病毒的高遺傳變化性和高進化率，預計每年每個位點（site）有10-4到10-3次替換。

　　此前針對冠狀病毒的全基因組分析估計，冠狀病毒的進化速度與其他快速進化的RNA病毒相同；但其中值得注意的是，冠狀病毒的刺突基因（Spike gene）進化速度，比同一病毒中其他基因的進化要快。該基因的編碼蛋白（Spike，S蛋白）感染機體的關鍵組分，能夠與宿主細胞受體相互作用。

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　　冠狀病毒基因重組離不開S蛋白

　　因此，該研究團隊嘗試通過對新冠病毒的基因進行分析，以確認該病毒的起源以及其進化的方式。

　　首先，研究團隊重點關注重組是如何促使β冠狀病毒實現在不同的亞屬病毒和宿主之間進化。為此，研究團隊分析了來自五個主要亞屬感染哺乳動物的45個β冠狀病毒序列；最終發現，β冠狀病毒在跨病毒亞屬基因和宿主進行重組時，往往涉及S蛋白。

　　在此基礎上，研究團隊對MERS（中東呼吸綜合征）病毒的重組是否也涉及S蛋白進行了近一步研究。

　　選擇MERS病毒進行更深入分析，是因為該病毒是距離目前最近的，能夠讓人類和動物都受感染的病毒；同時該病毒也已經從人和駱駝的身上，進行了大量的采樣。結果發現，MERS病毒也大量涉及S蛋白的重組。

　　新冠病毒是通過重組方式產生的

　　那麼新冠病毒的祖先最早的重組事件是在什麼時候出現的呢？