新冠疫情: 新冠樣本出現D614G突變疫苗失效?

2020-07-05 | 來源: 華山感染 | 轉到微信 | 有0人參與評論 | 字體: 放大縮小 | 收藏 | 打印

　　2020年7月3日，cell 雜志的一篇研究顯示29%的新冠病毒樣本都出現了D164G的變異，帶有該變異的病毒早已在歐洲及美洲傳播，並且感染細胞的能力較前增強，是否預示病毒傳播力增強和對尚未上市的疫苗造成失效風險呢？特別是北京這次疫情反彈中發現的病毒株也有這個突變，後續會對我國疫情會造成什麼樣的影響呢？

　　什麼是D614G突變？

　　冠狀病毒廣泛的宿主性以及自身基因組的結構特征使其在進化過程中易發生基因重組,呈現遺傳多樣性。D614G突變指的是新冠病毒的第614氨基酸位點 D（天冬氨酸）到 G（甘氨酸）的突變，位於S蛋白（圖1）。D614G突變的病毒株常伴有5'UTR中的C到T突變（相對於MN908947.3基因組的241位），3037位的C到T突變；在14408位的C到T突變。包含這4個遺傳連鎖突變的單倍型現已成為全球優勢形式，根據GISAID數據庫公布的新冠病毒測序結果，發現攜帶該突變的病毒株主要歸類於G型、GR型和GH型。

　　

　　圖1（圖片來源：左圖源自網絡；右圖源自Zhang L, Jackson C B, Mou H, et al. The D614G mutation in the SARS-CoV-2 spike protein reduces S1 shedding and increases infectivity[J]. bioRxiv, 2020.）

　　為什麼如此關注D614G突變病毒株？

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　　截止到目前，根據GISAID數據庫上公布的所有新冠病毒基因組序列上一共發現了超過1萬個不同位點突變，但D614G引起了廣泛的關注。

　　1）傳播范圍、數量以及占比方面：今年3月份之前，攜帶有這個突變的各型病毒株還遠沒有成為全球主流，僅占全球所公布的病毒株測序序列的不到10%。在歐洲最早發現後不斷擴散傳播到北美洲、大洋洲、南美洲以及亞洲，整個3月，這個數字猛增到了60-70%。截止到6月底已經超過90%。因此，攜帶有這個突變的病毒株已經成為了傳播的主要基因型（圖2）。

　　圖2（圖片來源：Korber B, Fischer W M, Gnanakaran S, et al. Tracking changes in SARS-CoV-2 Spike: evidence that D614G increases infectivity of the COVID-19 virus[J]. Cell, 2020.；Daniloski Z, Guo X, Sanjana N, et al. The D614G mutation in SARS-CoV-2 Spike increases transduction of multiple human cell types[J]. bioRxiv, 2020.）

　　2）潛在功能方面：D614G突變是一個錯譯突變（改變氨基酸的變異），而且該突變位於新冠病毒的刺突蛋白（spike protein，S蛋白）上（圖3），該蛋白是新冠病毒入侵人體細胞的核心武器，也是目前許多疫苗和療法所重點針對的目標。因此，刺突蛋白上的突變更容易吸引眾多研究人員的注意—這些突變可能會改變刺突蛋白的結構、性質和活力，進而讓病毒更加容易入侵人體細胞。